IIAA

Visión general

IIAA (del inglés, Iterative Internet Autonomous Agent), es una herramienta que hemos desarrollado para ayudarnos a buscar en las enormes y crecientes bases de datos de artículos de investigación para descubrir nuevos marcadores de tumores para incluir en futuras versiones de nuestros tests.

Actualmente, IIAA funciona en un cluster de servidores en la nube y compila en modo 24/7 (24 horas al día y 7 días a la semana) una lista de proteínas (con más de 1.000 ya indexadas) que se creen expresadas diferencialmente en varios tipos de cáncer en humanos. En estos momentos, estamos utilizando solamente la base de datos PubMed ―del National Center for Biotechnology Information (NCBI)―, pero en el medio plazo incluiremos también la base de datos EMBASE, así como búsquedas en lo que se conoce como “literatura gris” ―millones de documentos que no se difunden por los canales ordinarios de publicación comercial, y que por tanto plantean problemas de acceso―. Estas proteínas, de las que sólo algunas de ellas han sido detectadas en el plasma sanguíneo hasta la fecha, representan una población de marcadores tumorales plasmáticos candidatos a poder ser útiles en la detección temprana del cáncer en el futuro.

Para cada una de las proteínas identificadas anteriormente, se realiza una búsqueda iterada de segundo nivel usando el nombre de proteína junto con el nombre de diferentes tipos de cáncer (tal como “páncreas” o “cáncer de páncreas” para cáncer de páncreas). Con esto buscamos priorizar estos marcadores para su validación futura por la frecuencia de las citas bibliográficas, tanto totales como en función del tiempo.

Los candidatos incluyen proteínas implicadas en la “oncogénesis”, “angiogénesis”, “desarrollo”, “diferenciación”, “proliferación”, “apoptosis”, “hematopoyesis”, “respuestas inmunes y hormonales”, “señalización celular”, “hidrólisis”, “localización celular”, “ciclo celular y estructura”, “respuesta en fase aguda” y “control hormonal”.

Muchas de ellos han sido detectadas en estudios de tejidos o componentes nucleares; sin embargo, nosotros nos alineamos con la hipótesis de que la mayoría ―si no todas―, deben estar presentes en el plasma aunque sea en pequeñas proporciones. Además, nos hemos encontrado que, de todos las proteínas candidatas, sólo un pequeño grupo ha sido aprobado como “antígenos asociados a tumores” por la US Food and Drug Administration (FDA) ―algo a tener en cuenta para acelerar la comercialización de nuestros futuros tests MBDAA en los Estados Unidos―.

Gracias a los resultados obtenidos, creemos que esta validación a gran escala de marcadores tumorales candidatos cubrirá la brecha existente entre la investigación básica y el uso clínico de diagnósticos avanzados, lo que nos permitirá crear otros tests MBDAA en menos tiempo que los tests ya desarrollados y certificados, como los tests OncoBREAST Dx, OncoLUNG Dx, OncoOVARIAN Dx, OncoPROSTATE Dx y OncoCUP Dx.