IIAA

Visão geral

O IIAA (do inglês, Iterative Internet Autonomous Agent), é uma ferramenta que desenvolvemos para nos ajudar a pesquisar os enormes e crescentes bancos de dados de artigos de pesquisa para descobrir novos marcadores tumorais a serem incluídos em futuras versões de nossos testes.

Atualmente, o IIAA opera num cluster de servidores na nuvem e compila no modo 24/7 (24 horas por dia e 7 dias por semana) uma lista de proteínas (com mais de 1.000 já indexadas) que se acredita serem diferencialmente expressas em vários tipos de cancro em humanos. Neste momento, estamos usando apenas o banco de dados PubMed, mas a médio prazo também incluiremos o banco de dados EMBASE bem como buscas no que é conhecido como “literatura cinzenta” – milhões de documentos que não são divulgados através dos canais comuns de publicação comercial e que, portanto, apresentam problemas de acesso. Essas proteínas, das quais apenas algumas delas foram detectadas no plasma sanguíneo até o momento, representam uma população de marcadores tumorais plasmáticos que podem ser úteis na detecção precoce do cancro no futuro.

Para cada uma das proteínas identificadas acima, uma pesquisa iterada de segundo nível é realizada usando o nome da proteína, juntamente com o nome de diferentes tipos de cancro (como “pâncreas” ou “cancro de pâncreas” para cancro pancreático). Com isso buscamos priorizar esses marcadores para futura validação pela frequência das citações bibliográficas, tanto em termos totais quanto em função do tempo.

Os candidatos incluem proteínas envolvidas na “oncogênese”, “angiogênese”, “desenvolvimento”, “diferenciação”, “proliferação”, “apoptose”, “hematopoiese”, “respostas imunológicas e hormonais”, “sinalização celular”, “hidrólise”. , “Localização celular”, “ciclo celular e estrutura”, “resposta de fase aguda” e “controle hormonal”.

Muitos deles foram detectados em estudos de tecidos ou componentes nucleares; no entanto, alinhamos com a hipótese de que a maioria, senão todos, deve estar presente no plasma mesmo em pequenas proporções. Além disso, descobrimos que, de todas as proteínas candidatas, apenas um pequeno grupo foi aprovado como “antígenos associados a tumores” pela Administração de Alimentos e Medicamentos dos EUA (FDA), algo a ser considerado para acelerar a comercialização dos nossos futuros testes MBDAA nos Estados Unidos.

Graças aos resultados obtidos, acreditamos que essa validação em larga escala de marcadores tumorais candidatos cobrirá a lacuna entre a pesquisa básica e o uso clínico de diagnósticos avançados, o que nos permitirá criar outros testes MBDAA em menos tempo do que os testes já desenvolvidos. certificados, como testes OncoBREAST Dx, OncoLUNG Dx, OncoOVARIAN Dx, OncoPROSTATE Dx e OncoCUP Dx.