IIAA
Vue d’ensemble
IIAA (de l’anglais, Iterative Internet Autonomous Agent) est un outil que nous avons développé pour nous aider à parcourir les bases de données énormes et en croissance d’articles de recherche afin de découvrir de nouveaux marqueurs tumoraux à inclure dans les futures versions de nos tests.
Actuellement, l’IIAA opère dans un cluster de serveurs dans le cloud et compile en mode 24/7 (24 heures sur 24 et 7 jours sur 7) une liste de protéines (avec plus de 1,000 déjà indexées) qui seraient exprimées différentiellement dans plusieurs types de cancer chez l’homme. Pour le moment, nous utilisons uniquement la base de données PubMed ―du Centre National de Biotechnologie Information (NCBI)―, mais à moyen terme, nous inclurons également la base de données BASE, ainsi que des recherches dans ce que l’on appelle la “littérature grise” ―des millions de documents qui ne sont pas diffusés par les voies ordinaires de la publication commerciale et qui posent donc des problèmes d’accès―. Ces protéines, dont seules certaines ont été détectées dans le plasma sanguin à ce jour, représentent une population de marqueurs tumoraux plasmatiques qui pourraient être utiles dans la détection précoce du cancer à l’avenir.
Pour chacune des protéines identifiées ci-dessus, une recherche itérative de deuxième niveau est effectuée en utilisant le nom de la protéine ainsi que le nom de différents types de cancer (tels que “pancréas” ou “cancer du pancréas” pour le cancer du pancréas). Avec cela, nous cherchons à hiérarchiser ces marqueurs pour une validation future par la fréquence des citations bibliographiques, à la fois totales et en fonction du temps.
Les candidats incluent les protéines impliquées dans “l’oncogenèse”, “l’angiogenèse”, le “développement”, la “différenciation”, la “prolifération”, “l’apoptose”, “l’hématopoïèse”, “les réponses immunitaires et hormonales”, “la signalisation cellulaire”, “l’hydrolyse”, “localisation cellulaire”, “cycle cellulaire et structure”, “réponse en phase aiguë” et ”contrôle hormonal”.
On nombre d’entre eux ont été détectés lors d’études de tissus ou de composants nucléaires; Cependant, nous nous associons à l’hypothèse selon laquelle la plupart, sinon la totalité, doivent être présents dans le plasma, même dans de faibles proportions. En outre, nous avons constaté que, parmi toutes les protéines candidates, seul un petit groupe a été approuvé comme «antigène associé aux tumeurs» par la FDA (Food and Drug Administration), un élément à prendre en compte pour accélérer la commercialisation de nos futurs Tests MBDAA aux États-Unis.
Grâce aux résultats obtenus, nous pensons que cette validation à grande échelle de candidats marqueurs de tumeurs couvrira l’écart entre la recherche fondamentale et l’utilisation clinique du diagnostic avancé, ce qui nous permettra de créer d’autres tests MBDAA en moins de temps que les tests déjà développés et certificats, tels que des tests OncoBREAST Dx, OncoLUNG Dx, OncoOVARIAN Dx, OncoPROSTATE Dx et OncoCUP Dx.