IIAA

Panoramica

IIAA (inglese, Iterative Internet Autonomous Agent) è uno strumento che abbiamo sviluppato per aiutarci guardiamo le basi di dati enorme e crescente di articoli di ricerca per scoprire nuovi marcatori tumorali per l’inclusione nelle future versioni dei nostri test.

Attualmente, IIAA gira su un cluster di server in the cloud e la modalità di compilazione 24/7 (24 ore al giorno e 7 giorni alla settimana) un elenco di proteine (con più di 1.000 già indicizzati) da creare differenzialmente espressi in vari tipi di cancro negli esseri umani. In questo momento, stiamo solo utilizzando il database di PubMed ―da National Center for Biotechnology Information (NCBI)―, ma nel medio termine sarà anche includere il database EMBASE e le ricerche in quella che è conosciuta come “letteratura grigia” ―con più di miliardi di documenti che non sono diffusi attraverso i canali ordinari di pubblicazione commerciale e che pertanto pongono problemi di accesso―. Queste proteine, di cui solo alcune sono state rilevate nel plasma sanguigno fino ad oggi, rappresentano una popolazione di marcatori tumorali plasmatici che potrebbero essere utili nella diagnosi precoce del cancro in futuro.

Per ciascuna delle proteine identificate sopra, una ricerca iterata secondo livello viene eseguita utilizzando il nome proteine con il nome di diversi tipi di cancro (come “pancreas” o “cancro pancreatico” per il carcinoma pancreatico). Con questo cerchiamo di dare la priorità a questi indicatori per la futura convalida tramite la frequenza delle citazioni bibliografiche, sia totali che in funzione del tempo.

I candidati sono proteine coinvolte nella “tumori”, “angiogenesi”, “sviluppo”, “differenziazione”, “proliferazione”, “apoptosi”, “emopoiesi”, “immune e risposte ormonali”, “segnalazione cellulare”, “idrolisi” , “posizione cellulare”, “ciclo cellulare e struttura”, “risposta in fase acuta” e “controllo ormonale”.

Molti di questi sono stati rilevati in studi sui tessuti o componenti nucleari; tuttavia, ci allineiamo con l’ipotesi che la maggior parte, se non tutti, deve essere presente nel plasma anche in piccole proporzioni. Inoltre, abbiamo trovato che tutte le proteine candidati, solo un piccolo gruppo è stato approvato come “tumore antigeni associati” da parte della Food and Drug Administration (FDA) ―una cosa da considerare per accelerare la commercializzazione del nostro futuro test MBDAA negli Stati Uniti―.

Grazie ai risultati ottenuti, noi crediamo che questo grande scala convalida tumorali candidati marcatori coprirà il gap tra ricerca di base e l’uso clinico di diagnostica avanzata, permettendoci di creare altri test MBDAA in meno tempo rispetto alle prove già sviluppati e certificati, come OncoBREAST Dx, OncoLUNG Dx, OncoOVARIAN Dx, OncoPROSTATE Dx e OncoCUP Dx.